何気に便利なのに誰も使わないWindows Scriptですが、結構便利なんですけどね。@ITでWindows管理者のためのWindows Script Host入門と題して連載が始まっていたようです。
いわゆるシェル・スクリプトと比べると書くのが面倒ですが、出来上がったスクリプトは誰が見てもわかりやすいものになるはず。僕の場合は基本的にバッチファイルでやろうとして、コンソールがウザイとか簡単な分岐のためのダイアログを出したいときなんかにはWSHのwscriptの方を使ったりしてます。連載ではcscriptを推奨していますけど、個人で利用する場合はwscriptメインになるんじゃないですかね。
Perlでも書けますよ。使ったことないけど。